肿瘤突变负荷中国专家共识

发布日期:2021-01-22

  TMB(肿瘤突变负荷),一个肿瘤免疫治疗时代孕育而出的“苦命”娃,从2014年呱呱坠地开始,便命途多舛。2018年写入肺癌NCCN指南后迎来了人生的首个“巅峰”,可好景不长,2019年的WCLC和ESMO(KN021,KN189,CM227等)便让其连遭打击,差点“夭折”。但TMB还年轻,不服输不言弃的坚持使它得到了部分“贵人”(KN042,KN010,KN158等)的相助,“贵人”表示,TMB在免疫联合方面的预测性较差,但在免疫单药治疗疗效方面的预测还是可行,应辩证看待TMB的“成长”。

  TMB作为免疫治疗疗效敏感性评估的关键生物标志物,已成为临床基因检测的标配,但检测方法、阈值和报告格式缺乏统一标准。2020年11月11日,《中国癌症防治杂志》正式发表了《肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)》,此TMB专家共识结合中国实践,对TMB检测的临床意义、检测过程中样本类型、检测方法、包含基因、生物信息学分析方法及参考值设定给出指导性建议。小编整理的主要内容如下:

1、目前研究证据显示在 NSCLC bTMBtTMB 具有显著相关性, 但 bTMB 检测无统一标准。多项回顾性研究发现高 bTMB NSCLC 患者接受单药 ICIs 治疗获益显著相关, 但尚未获得高级别前瞻性临床研究证实。

2、评估TMB的靶向Panle理想覆盖范围介于1.5~3.0Mb,高于几百个基因的靶向测序Panel准确性听不会显著提高。FDA批准的3款靶向测序Panel显示>=0.8Mb能满足临床需求。Panel的设计应尽量避免只选择原癌基因和抑癌基因,驱动突变,免疫治疗正向、负向预测因子等应尽可能包括。

3、2019年欧洲肿瘤内科学会ESMO推荐精准评估TMB最小覆盖深度>200x。

4、测序数据质控:数据有效率>99%,错误库<0.1,Q20>90%,Q30>85%,GC含量42%~55%,比对率>95%。

5、TMB算法:美国FDA批准的4个检测TMB肿瘤方法中,MSK-Impact(2017年,泛癌种467个基因,预期用途不包括TMB,但有文献支持)、Omics Core(2019年,19396个基因)、PGDxelio tissue complete(2020年,泛癌种507个基因)是通过患者白细胞对照,计算体细胞突变;Fundation One CDx(2017年,324个基因)以及获得FDA突破性器械待遇的TruSight Oncology 500只检测癌组织,不对正常组织作对照,其中FundationOne是通过人群数据库过滤和SGZ算法确定体细胞突变的。

6、TMB阈值确定:在不同癌种中显著差异,应依据ICIs临床疗效确定阈值,不同Panel也不能共用。

7、TMB报告解读包括:1、TMB评估,包括与WES比对一致性,2、结果解读:是否有明确阈值,不同癌种应列明不同阈值。